Abstract Angular leaf spot (ALS) and powdery mildew (PWM) are two important fungi diseases causing significant yield losses in common beans. In this study, a new genetic linkage map was constructed using single sequence repeats (SSRs) and single nucleotide polymorphisms (SNPs), in a segregating population derived from the AND 277 x SEA 5 cross, with 105 recombinant inbred lines. Phenotypic evaluations were performed in the greenhouse to identify quantitative trait loci (QTLs) associated with resistance by means of the composite interval mapping analysis. Four QTLs were identified for ALS resistance. The QTL ALS11AS, linked on the SNP BAR 5054, mapped on chromosome Pv11, showed the greatest effect (R2 = 26.5%) on ALS phenotypic variance. For PWM resistance, two QTLs were detected, PWM2AS and PWM11AS, on Pv2 and Pv11, explaining 7% and 66% of the phenotypic variation, respectively. Both QTLs on Pv11 were mapped on the same genomic region, suggesting that it is a pleiotropic region. The present study resulted in the identification of new markers closely linked to ALS and PWM QTLs, which can be used for marker-assisted selection, fine mapping and positional cloning.

A infecção de grãos de milho por Fusarium verticillioides, agente causal da podridão da espiga, pode resultar na produção de micotoxinas do grupo das fumonisinas. A resistência genética é a forma de controle mais eficiente dessa enfermidade. Assim, o objetivo do trabalho foi buscar fontes de resistência em linhagens de milho tropical à F. verticillioides e à produção de fumonisinas. Seis linhagens tropicais de milho, três, pré-classificadas como resistentes e três, pré-classificadas como suscetíveis à F. verticillioides, foram submetidas à inoculação do patógeno e posteriormente, avaliadas quanto à severidade da podridão de espiga, incidência de grãos sintomáticos e concentração de fumonisinas. Os resultados mostraram que as linhagens R1 e R3 apresentaram alta resistência à infecção do patógeno. No entanto, apenas a R3 foi resistente ao acúmulo de fumonisinas. Dessa forma, sugere-se que a ausência de relação entre intensidade da doença e níveis de fumonisinas seja fator inerente desse patossistema. Assim, não é possível assegurar que grãos assintomáticos quanto à infecção por F. verticillioides, estejam livres de contaminação por fumonisinas.

Maize infection by Fusarium verticillioides, the causal agent of Fusarium ear rot, can result in the production of mycotoxins of the fumonisin group. Genetic resistance is the most effective way to control this disease. Thus, the aim of this study was to evaluate tropical maize inbred lines as potential sources of resistance to F. verticillioides and production of fumonisins. Six maize inbred lines, three previously classified as resistant and three as susceptible to F. verticillioides, were inoculated with the pathogen and subsequently evaluated for ear rot severity, incidence of symptomatic grain and fumonisin concentration. Results showed that the lines R1 and R3 exhibited high resistance to the pathogen infection. However, only R3 was resistant to the accumulation of fumonisins. Therefore, it is suggested that absence of relationship between disease intensity and fumonisin production is inherent to this pathosystem. Thus, asymptomatic grains infected by F. verticillioides cannot be ensured to be free of contamination by fumonisins.

Zucchini yellow mosaic virus (ZYMV) causes substantial economic losses in cucurbit crops. Although ZYMV has been present in Brazil for more than 20 years, there is little information about the biological and molecular characteristics of the isolates found in the country. This study aimed to characterize the experimental hosts, pathotypes and genetic diversity of a collection of eleven Brazilian ZYMV isolates within the coat protein gene. For biological analysis, plant species from Amaranthaceae, Chenopodiaceae, Cucurbitaceae, Fabaceae, Solanaceae, and Pedaliaceae were mechanically inoculated and pathotypes were identified based on the reaction of a resistant Cucumis melo, accession PI414723. All of the cucurbit species/varieties and Sesamum indicum were systemically infected with all isolates. The nucleotide sequence variability of the coat protein gene ranged from 82 % to 99 % compared to the corresponding sequences of ZYMV isolates from different geographical locations. No recombination event was detected in the coat protein gene of the isolates.

O fungo Podosphaera xanthii afeta a cultura do meloeiro, apresenta diversas raças e é controlado por genes de resistência raça-específica. O acesso PI414723 é resistente às raças 1, 3 e 5 e é uma fonte adequada de genes de resistência. A herança da resistência a essas raças foi analisada em 87 plantas F2 do cruzamento PI414723 × Védrantais. A resistência às três raças pode ser explicada pela segregação de um gene dominante, embora um modelo digênico também possa ser aceito. Um mapa genético foi obtido com 206 marcadores e análise de co-segregação de fenótipos resistentes indicou a existência de dois locos ligados, posicionados no grupo de ligação II, um conferindo resistência às raças 1 e 5 (denominado Pm-x1,5) e o segundo à raça 3 (denominado Pm-x3), localizado a 5,1cM. Este estudo relata pela primeira vez a existência de Pm-x3 e as localizações genéticas desses genes de resistência de PI414723.

The fungus Podosphaera xanthii affects melon crops and presents several races controlled by race-specific resistance genes. The accession PI 414723 is resistant to races 1, 3 and 5 and it is a suitable source of resistance genes. The inheritance of resistance to these races was analyzed on 87 F2 plants from the cross of PI 414723 × Védrantais, and resistance to all three races could be explained by the segregation of a single dominant gene, although a digenic model could also be accepted. A genetic map was assembled with 206 markers, and co-segregation analysis of resistance phenotypes indicated the existence of two linked loci in linkage group II, one conferring resistance to races 1 and 5 (denominated Pm-x1,5), and the second to race 3 (denominated Pm-x3), located 5.1 cM apart. This study reports for the first time the existence of Pm-x3 and the genetic locations of these resistance genes from PI 414723.

The objective of this study was to estimate the reduction in yield caused by Colletotrichum graminicola in resistant and susceptible maize hybrids inoculated at different stages of development. Two trials were conducted in different environmental conditions in a randomized block design with treatments arranged as a 2 × 5 factorial scheme and three replications. Treatments consisted of two hybrids (H8664, resistant and H8621, susceptible) inoculated at three growing stages (8-leaf, 12-leaf and tasseling stage). Internal lesion length, adjusted yield, and yield components (length, diameter and ear weight) were evaluated 120 days after emergence. Significant differences in yield and ear weight were detected in the susceptible hybrid inoculated at the earliest stage: yield was reduced by 16.1 and 20.2% in the first and second experiment, respectively. Although lesion length in the susceptible hybrid was approximately three times greater than in the resistant, there were no significant differences in lesion length among treatments for each hybrid. However, there were differences in the number of dead plants and ear weight. It is suggested that damage caused by early infection with C. graminicola results mainly from plant death and reduction in ear weigh rather than from the extent of colonization of the stalk.

Análise de médias foi usada para estudar o modo de herança da resistência a antracnose do colmo em milho tropical. Cada população foi composta de seis gerações que foram avaliadas para resistência em dois ensaios no delineamento de blocos ao acaso. As inoculações foram realizadas usando uma suspensão de 10(5) conídios mL-1 aplicados dentro do colmo. O comprimento interno de lesão foi medido diretamente após abertura do colmo 30 dias após a inoculação. Os resultados indicaram modos contrastantes de herança. Em uma população, os efeitos gênicos dominantes predominaram. Embora as interações, aditivo x dominante e aditivo x aditivo, também foram encontradas. Valores intermediários de herdabilidade indicaram herança da resistência complexa, provavelmente condicionada por vários genes de pequeno efeito. O modelo genético aditivo-dominante foi suficiente para explicar a variação na segunda população, onde os efeitos aditivos predominaram. Poucos genes de grande efeito controlam a resistência neste cruzamento. Heterose diferiu amplamente entre as populações o que pode ser explicado pelo background genético das linhagens genitoras resistentes.

Generation means was used to study the mode of inheritance of resistance to anthracnose stalk rot in tropical maize. Each population was comprised of six generations in two trials under a randomized block design. Inoculations were performed using a suspension of 10(5) conidia mL-1 applied into the stalk. Internal lesion length was directly measured by opening the stalk thirty days after inoculation. Results indicated contrasting modes of inheritance. In one population, dominant gene effects predominated. Besides, additive x dominant and additive x additive interactions were also found. Intermediate values of heritability indicated a complex resistance inheritance probably conditioned by several genes of small effects. An additive-dominant genetic model sufficed to explain the variation in the second population, where additive gene effects predominated. Few genes of major effects control disease resistance in this cross. Heterosis widely differed between populations, which can be attributed to the genetic background of the parental resistant lines.

Catharanthus roseus is a perennial, evergreen herb in the family Apocynaceae, which is used as ornamental and for popular medicine to treat a wide assortment of human diseases. This paper describes a new potyvirus found causing mosaic symptom, foliar malformation and flower variegation in C. roseus. Of 28 test-plants inoculated mechanically with this potyvirus, only C. roseus and Nicotiana benthamiana developed systemic mosaic, whereas Chenopodium amaranticolor and C. quinoa exhibited chlorotic local lesions. The virus was transmitted by Aphis gossypii and Myzus nicotianae. When the nucleotide sequence of the CP gene (768nt) was compared with other members of the Potyviridae family, the highest identities varied from 67 to 76 %. For the 3' UTR (286nt), identities varied from 16.8 to 28.6 %. The name Catharanthus mosaic virus (CatMV) is proposed for this new potyvirus.

O meloeiro (Cucumis melo L.) é uma frutífera largamente cultivada no Brasil, principalmente no nordeste brasileiro, onde é produzida principalmente para a exportação. Plantas da família do meloeiro, como pepino e abóbora, podem ser severamente afetadas pelo oídio, causado por Podosphaera xanthii.. Este fungo apresenta diversas raças fisiológicas cuja correta identificação é importante para o manejo da doença, já que o uso de variedades resistentes é o método mais eficaz de seu controle. No entanto, a identificação destas raças por meio da prática tradicional de inoculações em uma série diferenciadora de variedades de meloeiro é laboriosa e passível de erros. Devido a isso, um método alternativo seria o uso de marcadores moleculares para determinar de forma rápida a identidade das raças. O objetivo deste estudo foi o de analisar a variabilidade entre isolados de P. xanthii previamente classificados em raças através da técnica de AFLP e do seqüenciamento da região ITS 5.8S do rDNA. A partir dos marcadores AFLP obteve-se um dendrograma no qual não houve separação dos isolados quanto às suas raças, origem geográfica ou hospedeiro de origem. Com esta técnica verificou-se alta variabilidade entre isolados, com similaridade genética máxima de 69% e similaridade mínima de 23%. Ao contrário da informação gerada por AFLP, não foi observada variação na sequência da região ITS 5.8S entre isolados. Desta forma, a análise por AFLP indicou que os isolados tem composição genética heterogênea muito embora este fato não tenha sido evidenciado pelo sequenciamento da região ITS.

Melon crop (Cucumis melo L.) is a fruit largely cultivated in Brazil, especially in the Northwestern region, where it is produced mainly for export. Plants of the melon family, such as cucumber and pumpkin, can be severely affected by powdery mildew, caused by Podosphaera xanthii. This fungus has several physiological races and their correct identification is important for managing the disease, since the use of resistant cultivars is the most effective method for its control. However, identification of races by the traditional method of inoculation in a differential series of melon varieties is laborious and error prone. Due to this, an alternative method would be the use of molecular markers to quickly determine the race identity. The objective of this study was to analyze the variability among P. xanthii isolates previously classified into races through the AFLP technique and sequencing of the rDNA's ITS 5.8S region. With the AFLP markers a dendrogram was generated, where the isolates could not be grouped according to their races, geographic region or host. With this technique, a high variability among isolates was verified, with maximum genetic similarity of 69% and minimum similarity of 23%. In contrast to the AFLP data, there was no sequence variation in the ITS 5.8S region among isolates. Thus the AFLP data indicated that the isolates have a heterogeneous genetic composition even though this was not evidenced by the sequencing of the ITS region.

Estudos foram realizados para analisar a caracterização genética usando marcadores de RFLP-ITS e ISSP e a amplicação do gene de patogenicidade cap20 por PCR em isolados de Colletotrichum gloeosporioides de diferentes hospedeiros. Primers para o gene cap20 foram construídos a partir de seqüências selecionadas do GenBank (National Center of Biotechnology Information, http://www.ncbi.nlm.nih.gov) com o programa Primer 3. A análise dos dendrogramas revelou que o marcador RFLP-ITS foi mais informativo em separar as espécies de Colletotrichum, e que o primer EI1 evidenciou maior diversidade genética. A amplificação do DNA dos isolados de Colletotrichum para o gene cap20 com os primers P1 e P2 indicou que este gene pode apresentar variações dentro de C. gloeosporioides relacionada ao hospedeiro, e que também está presente em outras espécies de Colletotrichum.

Studies were performed to analyze the genetic characterization using RFLP-ITS and Intron (primer EI1) markers and the amplification of the cap20 pathogenicity gene by PCR in Colletotrichum gloeosporioides isolates of different hosts plant. The genetic variability was accessed using RFLP-ITS and Intron markers and grouping by UPGMA method. Primers to cap20 gene were constructed using selected sequences of the GenBank (National Center of Biotechnology Information, http://www.ncbi.nlm.nih.gov) with the Primer 3 program. The dendrograms analysis showed that the RFLP-ITS marker was more informative to separate the Colletotrichum sp, and that primer EI1 demonstrated greater genetic diversity. The amplification of the DNA of the Colletotrichum isolates to the cap20 gene with primers P1 and P2 indicated that this gene could present variations into C. gloeosporioides related with the host, and also that it was present in other Colletotrichum sp.

Na cultura do milho as podridões de espigas causadas por fungos destacam-se como uma das principais responsáveis pelas perdas em produção e qualidade, principalmente devido a formação dos chamados grãos ardidos. O objetivo deste trabalho foi o de identificar a micoflora presente em grãos e sementes produzidos em difer entes regiões e zonas macro-climáticas do Brasil, nos períodos de safra e safrinha. A determinação da incidência dos gêneros fúngicos foi feita pelo método do papel de filtro com congelamento. Foram a nalisa dos duzentos grãos/ sementes por amostra em um total de 44 amostras de grãos ardidos e 12 de sementes. As análises foram efetuadas sob mi croscópio estereoscópico e microscópio ópt ico. Os principais fungos encontrados neste levantamento, tanto em sementes como em grãos ardidos, foram Penicillum sp., Fusarium spp., Aspergillus spp., Cladosporium sp., Cephalosporium sp. e Stenocarpella spp. Dentre os patógenos principais, Fusarium spp. e Penicillium sp. foram os gêneros encontrados em maior incidência tanto nos grãos como nas sementes nas duas safras. Não houve diferenças significativas entre os diferentes climas e regiões na safra verão para a incidência de Fusarium spp. e Penicillium sp. Porém, durante a safrinha, foi observada uma maior incidência de Fusarium spp. na região CO. Cladosporium sp. se destacou entre os fungos sobretudo durante a safrinha.

In maize crop, ear rot caused by fungi is one of the main responsible for quality and production losses, mainly because of the development of the so called discolored grains. The purpose of this study was to identify the mycoflora present in grains and kernels produced in different regions and climatic zones of Brazil during summer and winter harvest and relate the occurrence of fungi with such parameters. The identification of the fungi was done by the filter paper with freezing method. Two hundred grains/kernels for sample totaling 44 samples of discolored grains and 12 of kernels were analyzed. The tests were performed under a stereomicroscope and an optical microscope. The main fungi found in this survey, both in kernel and discolored grains were Penicillium sp., Fusarium spp., Aspergillus spp., Cladosporium sp. Cephalosporium sp. and Stenocarpella spp. Among the major pathogens, Fusarium spp. and Penicillium spp. were found in higher incidence in grains and kernels in both seasons. There were no significant differences between regions and climates in the summer season for Fusarium spp. and Penicillium sp. incidence. However, during the winter season there has been observed a higher incidence of Fusarium spp. in the region CO. Cladosporium sp. stood out among fungi especially during the winter season.

A ferrugem, causada pelo fungo Puccinia psidii, é atualmente a mais importante doença do eucalipto. Esta doença está amplamente disseminada pelo Brasil e causa sérios danos em viveiros e plantações. A identificação de germoplasma resistente aliado ao conhecimento da base genética da resistência são os requerimentos primordiais para o sucesso de programas de melhoramento visando à produção de cultivares resistentes. Estudos anteriores sobre a herança da resistência em condições controladas sugerem tanto uma herança monogênica como a participação de pelo menos 2 genes conferindo resistência à doença. O objetivo deste estudo foi avaliar a resistência a P. psidii, em condições de campo em quatorze progênies obtidas a partir de cruzamentos e auto-cruzamentos controlados entre quatro clones híbridos de Eucalyptus grandis Hill ex Maiden x Eucalyptus urophylla ST Blake,que contrastam para a resistência ao fungo. Os resultados indicam que a resistência pode ser explicada por um loco com efeito principal e pelo menos três alelos diferentes, com interações entre os alelos, resultando no fenótipo de resistência ou suscetibilidade. Entretanto, locos com menor efeito devem influenciar a resistência, uma vez que foram observadas variações nas classes de severidade da escala utilizada. Nenhuma diferença na segregação para a resistência foi observada entre cruzamentos recíprocos, sugerindo que não existe influência citoplasmática no controle deste caráter.

Rust caused by the fungus Puccinia psidii is currently the most important disease of eucalyptus. It is widely disseminated in Brazil, and causes serious damage in nurseries and plantation areas. The identification of resistant germplasm along with knowledge of the genetic basis of resistance heredity are the first requirements for the success of breeding programs aiming to develop resistant varieties. Earlier studies carried out under controlled conditions suggested a monogenic control as well as the participation of at least two genes promoting resistance to rust. The goal of this study was to evaluate the resistance to P. psidii under field conditions in fourteen progenies from controlled crosses and self-crosses among four hybrid clones of Eucalyptus grandis Hill ex Maiden x Eucalyptus urophylla ST Blake that contrast for resistance to the fungus. Results indicated that resistance could be explained by one locus with main effects and at least three different alleles. However, loci with minor effects may influence the resistance, since variation on severity classes was observed. Differences in segregation of resistance between reciprocal crosses were not observed, indicating absence of cytoplasmic effects.

O raquitismo-da-soqueira (RSD), causado pela bactéria Leifsonia xyli subsp. xyli, é uma das mais importantes doenças da cana-de-açúcar nas regiões produtoras do mundo. O presente trabalho teve como objetivo avaliar o grau de resistência de 10 variedades comerciais RB de cana-de-açúcar mais a variedade CB 49-260, a qual foi incluída como padrão suscetível. O trabalho visou avaliar os danos amostrados em campo pelo peso das parcelas em função da relação entre a produtividade de parcelas inoculadas e não inoculadas artificialmente com a bactéria. Os resultados mostraram que as variedades RB 72 454, RB 83 5486, RB 86 7515, RB 92 5211, RB 92 5268, RB 92 5345, RB 92 8064 e a variedade padrão CB 49-260 comportaram-se como variedades suscetíveis. A variedade RB 85 5156 comportou-se como de resistência intermediária e apenas as variedades RB 85 5453 e RB 85 5536 comportaram-se como tolerantes.

Ratoon stunting disease (RSD) caused by bacteria Leifsonia xyli subsp. xyli is one of the most economically important disease of sugarcane worldwide. The present survey had objective to evaluate the resistance of 10 RB commercial cultivars of sugarcane including CB 49-260 as a susceptible standard. The study evaluated the correlating the damages presented for overhauls productivity of inoculate and non inoculate parcels with the bacteria. The results showed that varieties RB 72 454, RB 83 5486, RB 86 7515, RB 92 8064, RB 92 5211, RB 92 5345 and RB 92 5268 were susceptible. RB 85 5156 had a intermediary resistance and varieties RB 85 5453 and RB 85 5536 both showed tolerant behavior.

Plantas de Capsicum annuum cv. Magali R, resistentes ao Pepper yellow mosaic virus (PepYMV), exibindo sintomas severos de mosaico amarelo, malformação foliar e subdesenvolvimento foram encontradas em plantios na região de Lins, SP, Brasil, em 2003/04. Partículas semelhantes àquelas do gênero Potyvirus foram observadas em extrato foliar de planta infectada examinado em microscópio eletrônico de transmissão. O extrato foliar também reagiu com anti-soro contra o PepYMV em PTA-ELISA. Além de C. annuum cv. Magali R, esse potyvirus também infectou sistemicamente C. annuum cv. Rubia R, que é resistente ao PepYMV. A seqüência de nucleotídeos de parte do gene da proteína capsidial (CP) desse potyvirus apresentou 96-98% de identidade com a de outros isolados do PepYMV. A seqüência parcial de nucleotídeos da região 3' não traduzida (3' NTR) apresentou 94-96% de identidade com a do PepYMV. Esses resultados são indicativos de que o potyvirus que quebrou a resistência em pimentão é um isolado do PepYMV.

Plants of Capsicum annuum cv. Magali R, resistant to Pepper yellow mosaic virus (PepYMV), which showed severe yellow mosaic, leaf malformation and stunting were observed during the 2003/04 growing season in Lins, São Paulo State, Brazil. Potyvirus-like particles observed in leaf sap from infected plants under the electron microscope reacted with an antiserum against PepYMV in PTA-ELISA. In addition to C. annuum cv. Magali R, this potyvirus also infected systemically the resistant C. annuum cv. Rubia R. The nucleotide sequence of part of the CP gene of this potyvirus shared 96-98% identity with that of other PepYMV isolates. The partial nucleotide sequence of the 3' NTR showed 94-96% identity with that of PepYMV. These data indicate that this potyvirus is a resistance-breaking isolate of PepYMV.

Brazil produced 330,000 metric tons of melons in 2005, principally in the Northeast region where one of the most important melon pathogens is the powdery mildew fungus Podosphaera xanthii. The disease is controlled mainly by incorporating single dominant resistance genes into commercial hybrids. We report on linkage analysis of the Pm-1 resistance gene, introgressed from the AF125Pm-1 Cantalupensis Charentais-type breeding line into the yellow-fleshed melon (Group Inodorus) breeding line AF426-S by backcrossing to produce the resistant line AF426-R, and the amplified fragment length polymorphism (AFLP) marker M75/H35_155 reported to be polymorphic between AF426-S and AF426-R. Segregation analysis of M75/H35_155 using a backcross population of 143 plants derived from [AF426-R x AF426-S] x AF426-S and screened for resistance to P. xanthii race 1 produced a recombination frequency of 4.9%, indicating close linkage between M75/H35_155 and Pm-1. Using the same segregating population, the M75/H35_155 marker had previously been reported to be distantly linked to Prv¹, a gene conferring resistance to papaya ringspot virus-type W. Since M75/H35_155 is linked to Prv¹ at a distance of 40.9 cM it is possible that Pm-1 and Prv¹ are also linked.

A cachaça é uma bebida típica brasileira produzida a partir da destilação do caldo de cana-de-açúcar fermentado principalmente por Saccharomyces cerevisiae. Grande parte da produção nacional é artesanal, e não há uma preocupação por parte dos produtores quanto ao controle microbiológico da fermentação. Este trabalho objetivou caracterizar a comunidade bacteriana contaminante do fermento utilizado na produção de cachaça em um alambique artesanal. Foram coletadas quatro amostras, sendo uma (NA) utilizada como efeito comparativo e coletada um ano anterior às demais. As restantes foram coletadas em três diferentes períodos: ao final do primeiro dia de fermentação (NP), após quinze dias (NS) e trinta dias após a utilização do mesmo fermento (NT). Foram analisadas, a partir do seqüenciamento parcial do gene 16S rDNA, 587 seqüências. As análises das seqüências revelaram a presença de 170 unidades taxonômicas operacionais. Destas, 152 foram identificadas uma única vez em diferentes amostras, dezessete foram comuns em pelo menos duas amostras e somente uma foi identificada em três amostras, evidenciando uma grande dinâmica populacional bacteriana durante o processo fermentativo. Análises estatísticas revelaram diferenças na composição bacteriana entre as amostras. Foram encontradas espécies ainda não descritas na literatura em fermentos para a produção de cachaça, como Weissella cibaria, Leuconostoc citreum e algumas espécies de Lactobacillus, além de bactérias não conhecidas. Os resultados revelaram que a comunidade de bactérias contaminantes do processo fermentativo é muito mais complexa do que se conhecida. Não há conhecimento de relato anterior sobre a utilização desta técnica para determinar contaminantes bacterianos em fermentos de cana-de-açúcar para produção de cachaça.

Cachaça is a typical Brazilian liquor produced from the distillation of fermented sugarcane juice mainly by Saccharomyces cerevisiae. Most of the domestic production is artisanal, and producers usually are not concerned regarding microbiological control of the fermentation. This study aimed to characterize the contaminant bacterial community of the yeast used in the production of cachaça in an artisanal still. Four samples were collected, of which one (NA) was used for comparison purposes and was collected one year earlier. The remaining samples were collected at three different periods: at the end of the first day of fermentation (NP), after fifteen days (NS), and thirty days after the same yeast was used (NT). Five hundred and eighty-seven sequences were analyzed from the partial sequencing of the 16S rDNA gene. Sequence analyses revealed the presence of 170 operational taxonomic units (OTUs). Of these, only one was shared among three samples and seventeen were shared between two samples. The remaining 152 OTUs were identified only once in distinct samples indicating that the contaminant bacterial population is highly dynamic along the fermentation process. Statistical analyses revealed differences in bacterial composition among samples. Undescribed species in the literature on yeasts of cachaça were found, such as Weissella cibaria, Leuconostoc citreum, and some species of Lactobacillus, in addition to some unknown bacteria. The community of bacteria in the fermentation process is much more complex than it was previously considered. No previous report is known regarding the use of this technique to determine bacterial contaminants in yeast for the production of cachaça.